Clarke, Mount Weather’ın güvenli duvarları ardında saklanan gerçeği tek başına ifşa etmeye çalışırken, içerideki diğer arkadaşları Jasper ve Monty buradaki konforlu hayata çoktan ayak uydurmuştur. Dağ halkının onlara sunduğu taze yiyecekler ve medeniyet kırıntıları gençlerin gözünü boyarken, Clarke sığınağın derinliklerinde saklanan tıbbi tünellere sızarak insanlık dışı deneylerin ilk izlerine ulaşır ve buranın aslında bir hapishane olduğunu anlar.
Yeryüzünde ise Şansölye Kane, kampın güvenliğini sağlamak adına sert tedbirler alırken, ilk sezondan tanıdığımız gençlerin serbest ve isyankar tavırlarını kontrol etmekte zorlanır. Bellamy, dağda esir tutulduğuna inandığı arkadaşlarını kurtarmak için yetişkinlerin pasif emirlerine karşı gelerek gizli bir arama ekibi kurmaya karar verir. Bu durum, Ark’ın askeri hiyerarşisi ile dünyada pişmiş gençler arasında ciddi bir otorite çatışması doğurur.
Aynı esnada uzay boşluğunda, Ark istasyonunun kalıntılarında mahsur kalan Şansölye Jaha ise oksijeninin son damlalarıyla dünyadaki halkına ulaşabilmek için mucizevi ve intiharvari bir kaçış planı tasarlamaktadır. Yeryüzünün, gökyüzünün ve yeraltının kader bağları bu bölümde daha da gerilimli bir hal alacaktır.